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近日，山东省农业科学院家禽研究所鸡遗传育种与繁育创新团队完成的研究论文在《农业科学学报》(英文)（Journal of Integrative Agriculture，JIA) 正式发表。该研究基于山东地方鸡种的基因组数据，筛选出在品种形成过程中受到选择的基因，解析了山东地方鸡种品种特异性表型的遗传基础。

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琅琊鸡。山东农科院供图

鸡肉作为我国第二大肉类消费品，是百姓膳食结构中动物性蛋白的主要来源之一。世界范围内有不同品种、类型的鸡，它们的品种特征各不相同，是宝贵的遗传资源。中国鸡遗传资源极其丰富，为体型外貌、体重、繁殖、适应性等一系列重要性状的精准鉴定提供了重要的素材。目前，对影响这些鸡种特异性表型的遗传决定因素的研究还有待进一步加深。深入了解品种特异性表型变异的潜在遗传机制可以帮助育种者培育和改良鸡品。

该研究对7个来自山东省的本地品种共140只鸡和20只引进的隐性白羽鸡的全基因组进行了重测序。基于常染色体单核苷酸多态性的群体基因组比较，揭示了鸡群基于地理距离的聚类模式。研究确定了甲状腺刺激激素受体 (繁殖性状、生理节律)、红细胞膜蛋白带4.1样1 (体型大小) 和烷基甘油单加氧酶 (攻击行为) 是主要候选的鸡品种特异性决定基因。此外，研究利用机器学习分类模型对鸡的品种进行判别，预测准确率为92%，可有效实现莱芜黑鸡的品种鉴定。

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莱芜黑鸡。山东农科院供图

该研究首次提供了山东地方鸡种的完整基因组数据，相关分析揭示了山东地方鸡种的地理模式和鸡的品种特异性性状相关的潜在的候选基因。该研究揭示的地方鸡品种的遗传基础有助于更好地理解鸡品种资源特性的内在机制。

山东省农业科学院家禽研究所鸡遗传育种与繁育创新团队副研究员刘杰为论文通讯作者。研究由国家肉鸡产业技术体系、山东省良种工程、山东省自然科学基金和山东省农业科学院农业科技创新项目资助。